La "ventana de propiedades" nos permite inicializar los valores de las propiedades del objeto que se encuentra seleccionado en el formulario (Button, MonthCalendar, TextBox etc.)
Por ejemplo si disponemos dos objetos de la clase Button y seleccionamos uno de ellos podremos editar las propiedades del mismo en la "ventana de propiedades":
A medida que seleccionamos un objeto en la ventana de "Diseño" podemos ver como se actualiza la "ventana de propiedades", por ejemplo la propiedad Text de la clase Button permite fijar la etiqueta que muestra el botón.
El formulario también es un objeto, esto quiere decir que si lo seleccionamos luego la "ventana de propiedades" nos muestra las propiedades de la clase Form: